I 1999 ble NST utnevnt som Nasjonalt kompetansesenter for telemedisin av myndighetene. Vår oppgave som kompetansesenter er å samle, produsere og formidle kunnskap om telemedisin, nasjonalt og internasjonalt. NST skal motivere helsevesenet til å ta i bruk telemedisin og e-helse der det kan gi god kvalitet og effektiv drift, men vi har ikke ansvar for at helsevesenet tar i bruk ny teknologi og vi tilbyr ikke behandling av pasienter.
NST har siden 2002 vært samarbeidssenter for Verdens helseorganisasjon (WHO). Siden 2006 har senteret vært vertsinstitusjon for Tromsø Telemedicine Laboratory (TTL), som er et senter for forskningsdrevet innovasjon i regi av Norges forskningsråd.
